寻找超越基因缺陷来描述癌症

总结

基因测序的进展已经揭示了许多信息，可以导致癌症的基因突变。但是，看起来只有在肿瘤基因变化的技术，可能会错过其他类型的缺陷。从MSK协同小组使用了一种不同的技术来研究患者&rsquo；肿瘤，发现有些改变可能比预期的更常见。

集锦 研究者在RNA &mdash改变；有助于把DNA到蛋白质的分子&mdash；蛋白质的DNA编码。 他们发现了一个新的RNA分子，'的版本；进行ALK蛋白。 这个ALK基因是已知的癌症中发挥作用，并有目标的突变体ALK蛋白的药物。 分析肿瘤的新方法可以使更多的患者受益于这些药物。

基因测序技术在过去的十年中的进展已经揭示了一个能导致癌症的基因突变数据宝库。但这些技术只看肿瘤DNA的改变，可能会错过其他缺陷&mdash；具体而言，改变RNA（帮助把蛋白质分子）和蛋白质的DNA编码。

现在一个合作团队从纪念斯隆-凯特琳采用了一种不同的技术来研究患者'发现RNA片段；肿瘤和发现一些异常RNA和它们所编码的蛋白可能比以前预期的更常见。这一发现表明，更多的患者可能受益于靶向治疗比以前认为的。

特别是，他们发现了一个新的RNA分子，'版本；用于使ALK蛋白已知肺癌和其他肿瘤的作用。研究者们发现，ALKRNA和蛋白质可以改变，即使有使蛋白质的指令基因是正常的。

&ldquo；我们发现这个特别版本的ALK的发生是由于表观遗传机制，&rdquo；说MSK医师科学家平志，谁是最近的研究，包括研究的资深作者，发表在杂志上自然。表观遗传学是指通过从一代到下一代的细胞而不是DNA序列中编码的信息。表观遗传的变化会影响脱氧核糖核酸的方式，然后翻译成蛋白质。

表观遗传学是指通过从一代到下一代的细胞而不是DNA序列中编码的信息。

虽然这些后生变化不是由基因测序技术检测，有发现在RNA和蛋白的改变其他的方法。

&ldquo；技术比其他DNA测序可以发现改变ALK在肿瘤中是有用的”；她说。&ldquo；测试，看看这个版本的ALKRNA和蛋白质使我们能够识别更多的患者可能从靶向药物治疗中获益。”；

肿瘤样本的变化

ALK，即间变性淋巴瘤激酶，是一种酶在大脑发育中具有重要作用。除了在神经系统中的其他组织，它通常是不存在的。正如它的名字所暗示的，它是与间变性大细胞淋巴瘤，非霍奇金淋巴瘤的一种罕见的亚型。在一半以上的情况下，该酶被改变在脱氧核糖核酸的水平。变化的ALK也有一小部分基因在非小细胞肺癌（NSCLC）发现，主要为腺癌；甲状腺癌；及小儿神经母细胞癌。

In the current study, Dr. Chi’s team analyzed more than 5,000 tumor samples from patients with 15 different cancer types using tests that looked for altered RNAs and proteins. They found the special ALKRNA in 11 percent of melanoma tumors and also sporadically in other cancer types.

“We could combine these other diagnostic modalities to study patients’ tumors and identify those who might benefit from treatment with ALKinhibitors,” says Dr. Chi, who is a member of MSK’s Human Oncology and Pathogenesis Program.

The special ALKRNA was found in 11 percent of melanoma tumors and also sporadically in other cancer types.

这些药物已经被用于ALK靶向。crizotinib（Xalkori  ；^注册；）和ceritinib  ；（Zykadia^TM）是由美国食品和药物管理局批准用于治疗ALK阳性的非小细胞肺癌被其他ALK阳性肿瘤的临床试验评价。

Based on the current research, along with earlier studies, the investigators expect to find abnormal expression of ALKRNA and protein in melanoma, especially melanoma tumors that have metastasized (spread) to other parts of the body.

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走进诊所

“The obvious next step is to identify patients with this special form of RNA and begin clinical trials to evaluate whether ALKinhibitors are an effective treatment for them,” Dr. Chi says. “We have already shown that this novel ALKvariant is sensitive to existing drugs that block ALKactivity.”

&ldquo；有很多在临床领域的兴趣识别更多的病人能够从这些药物，效益&rdquo；她说。&ldquo；但更多的工作需要做，如何确定最合适的患者选择这些试验的最有效的药物。”；

研究人员希望能够确定更多的患者可以接受靶向治疗。

她指出，MSK已经治疗一个病人通过使用同情&mdash；使患者进入临床试验&mdash外实验处理；发现有一些好处。病人，谁是与crizotinib治疗，有黑色素瘤，有进步的关心和研究治疗其他标准。

“It’s also conceivable that there are other cancer-causing proteins that arise through epigenetic mechanisms similar to this novel ALKvariant that are not detectable by typical genomic-based studies,” Dr. Chi says. “We have plans to move forward with computational-based analysis as well as further studies in the lab to look for some of these other proteins.”

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（注：转载时请注明复诊网）