大数据集为乳腺癌诊断和护理带来了精确性

尽管黑人和白人女性患乳腺癌的可能性几乎相同，但黑人女性死于此病的可能性高出42％。这种由社会和环境以及生物因素驱动的死亡率差距继续存在。

2017年5月4日在美国医学会杂志（JAMA Oncology）上发表的一项大型多机构研究旨在通过开始揭示黑人和白人女性乳腺癌的种系基因变异和肿瘤生物学差异来了解这一差距。作者指出，这是第一个“基于祖先的综合分析基因组和蛋白质组学数据的多种平台”。

这项研究的结果可能会导致非洲传统妇女更个性化的风险评估，加速开发旨在早期诊断侵袭性乳腺癌特定亚型的新方法，并有效治疗。

一项新的发现是，激素受体阳性，HER2阴性乳腺癌的黑人妇女的复发风险评分高于白人妇女。该研究还证实，黑人患者通常年龄较轻，且更可能发展侵袭性乳腺癌亚型，包括基底样或三阴性癌（缺乏雌激素受体，孕激素受体和HER2的肿瘤），以及其他侵袭性肿瘤亚型。

“患有贫穷，压力或缺乏照顾的黑人妇女长期以来患乳腺癌的死亡率，但是我们的研究结果显示，黑人妇女风险增加的很大一部分可归因于肿瘤生物学差异，这可能是基因决定的，“研究作者，芝加哥大学医学和人类遗传学教授Olufunmilayo Olopade博士说。

她说：“好消息是，当我们更多地了解这些基因变异时，我们可以将这些信息与临床数据结合起来，对风险进行分层，更好地预测复发 - 特别是对于高度可治疗的癌症 - 并制定干预措施以改善治疗结果“。

合着者北卡罗来纳州Lineberger综合癌症大学的成员Charles Perou博士说：“这是一个很好的例子，说明团队科学和科学投资如何加速确定最具侵袭性乳腺癌的最佳疗法的进展。北卡罗来纳大学医学院的遗传学，病理学和检验医学中心和教授。

他补充说：“在迄今为止最好的黑人女性肿瘤代表性最好的数据集中，我们发现黑色和白色女性肿瘤体细胞突变之间没有太大的区别。“然而，黑人妇女更可能发展积极的乳腺癌分子亚型。现在我们提供的数据显示，种系遗传差异可能是发生一种肿瘤亚型与另一种肿瘤亚型的可能性的高达40％。

该研究使用由美国国家癌症研究所和国家人类基因组研究所建立的癌症基因组图谱（TCGA）提供的930名妇女的DNA数据（154名主要为非洲血统和776名欧洲血统）。研究人员通过系统地梳理数据，寻找生殖系统变异（正常DNA），体细胞突变（肿瘤获得），乳腺癌亚型，生存时间，基因表达，蛋白表达和DNA甲基化模式等方面的种族差异。

第一作者，芝加哥大学公共卫生学副教授Dede Huo博士解释说：“最为显着的是，我们观察到黑人对雌激素受体阴性乳腺癌的遗传贡献更高。”

黑人女性更容易得到这些高度侵袭性的癌症。这是首次将遗传学与肿瘤亚型频率的种族差异联系起来的研究之一。

这项研究还显示了142个基因，表现出根据种族的表达水平的差异。一个基因CRYBB2（Crystallin Beta B2）在每个乳腺癌亚型以及正常组织中的黑色患者的肿瘤中一直较高，表明其可能是种族特异性基因。

研究人员还发现，13个基因或DNA片段的体细胞突变在黑人和白人妇女的肿瘤中频率不同。其中一个叫做TP53的突变基因在黑人女性（52％）中比在白人女性（31％）中更常见，并且是疾病复发的有力预测因子。

尽管TCGA数据集的随访时间相对较短，但我们能够使用无乳腺癌间隔作为非洲和欧洲祖先患者之间的终点，检测到患者生存中存在显着的种族差异“，合着，第一作者Hai胡志明博士，风洞研究院Chan Soons-Shiong分子医学研究所副研究员。“最糟糕的结果大部分来自非洲祖先基底样亚型乳腺癌患者。”

Olopade说：“所有类别的黑人妇女，包括最常见的乳腺癌，预后可能更差。

Perou说：“了解黑人和白人女性之间基本的潜在基因差异，更高的风险评分和复发风险应该引导我们采取替代治疗策略。

根据Olopade的研究，这项研究的关键的长期利益是“这是多基因生物标志物发展的一个步骤，这个工具可以帮助我们更好地了解每个患者的预后，而且当我们了解得更多时，在选择最好的治疗方法“。

“基因很重要，”她补充说。“这是精准医学的大门，科学的靶向治疗。”

Perou说：“这项研究为我们提供了个性化的乳腺癌风险评估方法，并制定了更好的策略，使所有的女性，特别是黑人女性能够了解他们的遗传学，并更积极地管理他们的风险。”

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