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科学家创造一种癌症代谢路线图

细胞中的化学反应,形成一个相互交织的网络通路,统称为代谢。这些反应为细胞提供必要的生活和成长的材料。

概要
越来越多的研究人员去研究代谢,化学反应发生在细胞的集体套房,对关于癌症的问题的答案。一个新的可搜索的数据库,探索艾滋病。

从Sloan Kettering纪念和Dana-Farber癌症研究所的科学家已经发表在代谢癌症的发展过程中发生的变化的开拓性,跨癌分析。他们创造有利于谁希望测试有关的代谢如何改变燃料癌症生长的假设研究人员数据库。该资源正在被提供在网上公开。

基于在七个不同类型的癌症超过900个肿瘤样本进行分析,结果集合是其规模最大的,并为未来研究的基准。一纸描述resultsappears今天在杂志电池系统。

根据MSK计算生物学家ED列兹尼克,也是该论文的通讯作者,路线图是什么的全基因组遗传代谢研究用于癌症相关基因搜索。

“我们知道有非常强大的基因组司机经常出现在不同的肿瘤类型,如KRAS基因进入胰腺癌,肺癌,和其他人,” 列兹尼克博士说“。同样的,我们发现的代谢变化,似乎在几乎所有的癌症类型,我们在我们的数据集发生普遍的共同特征。“

我们发现的代谢变化,似乎在几乎所有的癌症类型,我们在我们的数据集发生的共同特征。
编辑列兹尼克
ED列兹尼克
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但也有一些显着的差异太。某些代谢变化与更具侵略性和转移性肿瘤相关,例如。这引发了这些变化是否可能助长侵略性疾病过渡的问题。

解密代谢流量模式
为了进行这项研究,科学家分析了11以前发表的研究论文代谢数据团队。他们特别关注肿瘤代谢产物的测量,或小分子产物在细胞中的化学反应。奥古斯丁露娜计算生物学家,在实验室的生物信息学家克里斯桑德在达纳法伯CBIO中心,做了大量的标准化工作进行比较,在不同的数据集。

研究代谢产物提供了一个揭示细胞如何迅速代谢反应的一瞥是出发,即使是什么驱动的变化并不总是清晰。

博士列兹尼克它比喻为在曼哈顿的交通模式。 “可能有一吨的FDR道也只有一个一天的流量,”他说。 “对于一个解释可能是有一些对FDR正在做建筑工作,而且它阻碍交通。但是,这也可能是对的镇河滨车道另一边一路有一个巨大的意外,所有的流量溢出到罗斯福路“。

它类似于细胞内部,他说。代谢产物的结果提出有趣的问题,然后可以在实验室进一步研究

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正常与异常的肿瘤代谢的嫌疑人
发现了一些肿瘤的代谢变化并不奇怪。例如,乳酸水平往往在癌症中很高。这是因为许多肿瘤利用葡萄糖为燃料,和乳酸是反应的副产品,被称为糖酵解。

其他人则更为意外。一个不寻常的怀疑是犬尿氨酸,色氨酸衍生物。犬尿氨酸明显高于肿瘤与正常组织相比。不仅如此,它还更具有侵略性的肿瘤比低级别肿瘤在许多类型的癌症更高,研究人员发现。

基于超过900个肿瘤样本在七个不同类型的癌症的分析,由此产生的收集是最大的一种,为将来的研究基准。
犬尿氨酸是已知的抑制免疫细胞的免疫活性。一个可能的解释为什么它是肿瘤侵袭的升高是帮助他们逃避免疫系统的检测。但这只是一种假设,研究者很快指出。

从研究的另一个有趣的发现是,周围的正常组织的肿瘤有时也显示变化的邻近的肿瘤分级分期特征。 “这可能是指着什么实验室的科学家们可能希望在肿瘤微环境的研究,”列兹尼克博士指出。

博士红月希望新的分析将成为该领域的其他科学家,包括那些谁正在寻找潜在的治疗新途径一个起点。 “我们确实把它作为一个基准或起点的其他研究人员,”他说。

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