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通过建立更好的抗体编码

Fox Chase癌症中心的研究人员已经开发出一种基于计算机的方法设计的抵抗疾病的抗体,可以加强和改善那些已知是有效的。该方法涉及到建立新的软件,把蛋白质作为一个收集的部分可以调整,以新的方式组合设计的抗体,更有效地攻击感染,癌症离散块,和血液中的其他异物。体外试验表明,新设计的抗体是10到50倍优于现有的抗体结合并消除有害的病原体。

PLOS计算生物学杂志发表了一篇文章,详细介绍了测试最有前途的新抗体的实验方法和结果。 高级作者 罗兰dunbrack,Jr.博士,教授在分子治疗方案Fox Chase,带领团队,建立了抗体的设计方法在蛋白质结构模拟计算机平台的罗塞塔。新的方法,已经在使用的几种药物发现研究团队,被称为rosettaantibodydesign(rabd)。

的rabd平台扩展了早期的工作中,dunbrack创建了一个数据库的互补决定区(CDR)的三维结构分类300抗体–都是当时已知的。这篇论文发表在2011,和已知的抗体结构的宇宙已经增加到约900。的rabd程序利用所有的新结构,将继续扩大新的结构被确定。

“rabd允许科学家模拟抗体和他们已知攻击抗原之间的相互作用,和交换的各个组件是否可以提高结合或其他措施的有效性,”Dunbrack说。“这些相互作用模型在计算机前建立台架试验抗体会使研究更快,更便宜,更容易产生更好的抗体。”

新方案将大大加快研究新的药物来治疗癌症、艾滋病、流感、和许多其他的疾病和感染。目前,超过75的基于抗体的药物被FDA批准,许多临床试验正在进行中。

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