男性和女性衍生肿瘤样本的分析揭示了预后生物标志物,驱动癌症的基因以及可能预测治疗反应的关键途径调控的差异,根据癌症研究的两项研究发表的结果发表。美国癌症研究协会。
使用来自癌症基因组图谱(TCGA)的数据,Paul Boutros,博士,MBA及其同事分析了来自各种癌症的男性和女性来源肿瘤的突变负荷,体细胞拷贝数异常和体细胞单核苷酸变异的性别偏差。类型。研究人员观察到雄性和雌性样本之间突变密度和特定基因突变频率的巨大差异; 然而,并非所有肿瘤类型都显示出显着的性别偏见。作者还发现,来自雄性的肿瘤在几种肿瘤类型中降低了DNA错配修复基因的mRNA丰度,这反映在较高的肿瘤突变负担中。此外,观察到性别偏见的预后生物标志物,因为分析显示与肿瘤侵袭性相关的基因因性别而异。
“我们泛癌症分析的结果表明,男性和女性肿瘤的发病和进展方式存在根本性差异,”安大略省癌症研究所前任副教授,现任癌症数据科学主任的布特罗斯说。加州大学洛杉矶分校琼森综合癌症中心。“这表明研究人员需要认识到在生物标志物发现管道中纳入性别,特别是在转化研究领域。”
本研究的局限性包括研究的肿瘤类型子集较少,这是TCGA数据库的局限性。此外,作者还指出,他们的分析仅限于编码区域,编码区域只代表基因组的2%,Boutros指出。未来的工作将集中在基因组的非编码区域中的雄性和雌性样品之间的差异。
在使用TCGA数据的相关研究中,John Quackenbush博士,Camila Lopes-Ramos博士及其同事比较了来自男性和女性的结肠癌肿瘤的临床和基因组数据。研究人员发现常染色体男性和女性样本之间的基因表达没有显着差异。然而,在构建基因调控网络并进行差异靶向分析后,他们发现21个基因在男性和女性肿瘤之间受到差异调节。此外,作者发现,参与药物代谢的基因的调节在女性肿瘤中更为明显。与男性不同,如果他们的肿瘤对药物代谢途径有更强的调节作用,那么接受辅助化疗的女性总生存率会更高。
“我们的研究结果为调节结肠癌性别相关差异的调节机制提供了新的见解,”波士顿哈佛大学公共卫生学院生物统计学系主任Quackenbush说。“除了鉴定男性和女性之间差异调节的基因外,我们还能够将差异基因调控模式与临床结果联系起来。”
尽管作者控制了混杂效应,但Quackenbush指出,数据可能无法完全解释细胞或临床异质性以及患者的风险因素概况。
在这两项研究发表的评论中,来自加州大学洛杉矶分校的Arthur Arnold博士和来自西雅图华盛顿大学的Christine Disteche博士提供了X和Y染色体进化的简要描述。X染色体失活,以及这些过程在癌症发展中可能发挥的作用。作者认为,对性染色体不等效影响更敏感的特定基因通路的破坏可能会引发性别偏向的细胞反应,从而影响癌症的发病率和进展。他们指出,这里强调的两项研究提供了对基因组潜在性别不平等的进一步了解,这可能导致癌症,并提供有关生殖器官癌症之外的疾病中性别相关差异的进一步数据。
作者在评论中说:“如果我们要了解这些不同的癌症,就必须弄清楚性别差异的原因。” “这将有助于优化两性的治疗,并揭示可能提出新治疗策略的可能存在性别偏见的保护性或有害因素。虽然一些性别差异显然源于高度性别化的人类环境,这使得男性和女性对疾病风险的区别不同,但我们也可以在细胞内寻找基本的生物性别差异,从而降低肿瘤生长的几率。“
Boutros及其同事的研究得到了安大略省癌症研究所的支持; 发现前沿:在基因组学研究计划中推进大数据科学; 自然科学和工程研究理事会发现补助金; 加拿大卫生研究院资助; 和特里福克斯研究所奖。布特罗斯声明没有利益冲突。
Quackenbush及其同事的研究得到了国家癌症研究所和国立卫生研究院国家心肺血液研究所的资助。Quackenbush是Caris Life Sciences和Merck KGaA的科学顾问委员会成员。
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